30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_9540 on replicon NC_009359
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009359  OSTLU_9540  predicted protein  100 
 
 
97 aa  201  2e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.177599  normal  0.685809 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_6839  predicted protein  42.55 
 
 
101 aa  90.5  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40769  predicted protein  42.71 
 
 
102 aa  83.6  8e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0145425  normal  0.460561 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15016  predicted protein  38.14 
 
 
119 aa  83.6  9e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14143  predicted protein  37.76 
 
 
102 aa  79.7  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_9404  predicted protein  41.67 
 
 
96 aa  78.6  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0386241  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34891  predicted protein  39.36 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8749  predicted protein  34.02 
 
 
109 aa  77  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00773613 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41981  predicted protein  36.56 
 
 
99 aa  75.1  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.315481  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15516  predicted protein  40.43 
 
 
103 aa  69.7  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0761412  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_6817  predicted protein  38.3 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.280813  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43387  predicted protein  31.87 
 
 
115 aa  62.8  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_9737  predicted protein  37.5 
 
 
95 aa  62.8  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.180116  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_47583  predicted protein  32.22 
 
 
328 aa  62  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.164071 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50365  predicted protein  35.64 
 
 
707 aa  60.1  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.899784  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_7959  predicted protein  35.87 
 
 
98 aa  58.9  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32183  predicted protein  29.25 
 
 
246 aa  57.8  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549576  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67483  predicted protein  32.32 
 
 
657 aa  56.6  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10944  Pre-mRNA-splicing factor cef1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW35]  31.52 
 
 
791 aa  55.8  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01590  conserved hypothetical protein  29.35 
 
 
838 aa  54.3  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.196806  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35246  predicted protein  29.35 
 
 
668 aa  54.3  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0592899  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36337  predicted protein  31.37 
 
 
900 aa  53.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00279  FlbDPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q00658]  35.56 
 
 
314 aa  52.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.266348  normal  0.0299055 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08377  putative Myb-like transcription factor (Eurofung)  30.93 
 
 
288 aa  52.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.247587  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07174  putative Myb-like transcription factor (Eurofung)  32.65 
 
 
305 aa  52  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0643653  normal  0.181525 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31513  predicted protein  29.35 
 
 
756 aa  51.6  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13192  predicted protein  35.94 
 
 
74 aa  50.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63672  predicted protein  25.81 
 
 
712 aa  42  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04618  putative Myb-like transcription factor (Eurofung)  38.1 
 
 
724 aa  40.4  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.330664  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68096  predicted protein  32.26 
 
 
578 aa  40.4  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0298848 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>