16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_50897 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009048  PICST_50897  predicted protein  100 
 
 
504 aa  1045    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.406866 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70083  type II Golgi membrane protein  34.49 
 
 
559 aa  307  3e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82041  predicted protein  32.96 
 
 
664 aa  282  1e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32843  Golgi alpha-1,2- mannosyltransferase  33.2 
 
 
601 aa  268  2e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.334682 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53121  Golgi alpha-1,2- mannosyltransferase  33.2 
 
 
485 aa  261  3e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0568991  normal  0.285828 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30814  predicted protein  32.31 
 
 
503 aa  243  6e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.018903  normal  0.204154 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06857  alpha-1,2-mannosyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13090)  31.3 
 
 
490 aa  238  1e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.110194 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_11162  Golgi alpha-1,2- mannosyltransferase  32.13 
 
 
490 aa  235  1.0000000000000001e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.360349 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06571  alpha-1,2-mannosyltransferase (Mnn2), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04450)  32.34 
 
 
509 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00193217  normal  0.120409 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62462  predicted protein  27.77 
 
 
726 aa  151  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13927  predicted protein  28.64 
 
 
277 aa  72  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00170  expressed protein  33.33 
 
 
529 aa  65.1  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0350472  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00120  expressed protein  22.66 
 
 
731 aa  55.1  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.189279  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41315  alpha-1,3- mannosyltransferase  22.66 
 
 
550 aa  50.1  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.046308 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52586  mannosyltransferase  22.68 
 
 
759 aa  46.2  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0328138 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42671  predicted protein  26.17 
 
 
255 aa  44.7  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.151772 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>