15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_70083 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_70083  type II Golgi membrane protein  100 
 
 
559 aa  1158    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53121  Golgi alpha-1,2- mannosyltransferase  44.36 
 
 
485 aa  430  1e-119  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0568991  normal  0.285828 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32843  Golgi alpha-1,2- mannosyltransferase  40.51 
 
 
601 aa  403  1e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.334682 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_11162  Golgi alpha-1,2- mannosyltransferase  35.83 
 
 
490 aa  352  1e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.360349 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50897  predicted protein  34.49 
 
 
504 aa  283  4.0000000000000003e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.406866 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82041  predicted protein  34.54 
 
 
664 aa  258  1e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30814  predicted protein  37.57 
 
 
503 aa  244  1.9999999999999999e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.018903  normal  0.204154 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06571  alpha-1,2-mannosyltransferase (Mnn2), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04450)  32.39 
 
 
509 aa  214  4.9999999999999996e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00193217  normal  0.120409 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06857  alpha-1,2-mannosyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13090)  33.59 
 
 
490 aa  210  6e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.110194 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62462  predicted protein  26 
 
 
726 aa  160  4e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00170  expressed protein  26.01 
 
 
529 aa  64.3  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0350472  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13927  predicted protein  26.92 
 
 
277 aa  62.4  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00120  expressed protein  25.16 
 
 
731 aa  55.5  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.189279  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52586  mannosyltransferase  24.37 
 
 
759 aa  45.1  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0328138 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82608  mannosyltransferase  24.5 
 
 
802 aa  44.7  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.923251  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>