15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_53121 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_53121  Golgi alpha-1,2- mannosyltransferase  100 
 
 
485 aa  1010    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0568991  normal  0.285828 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32843  Golgi alpha-1,2- mannosyltransferase  47.9 
 
 
601 aa  481  1e-134  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.334682 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70083  type II Golgi membrane protein  44.36 
 
 
559 aa  430  1e-119  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_11162  Golgi alpha-1,2- mannosyltransferase  39.88 
 
 
490 aa  378  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.360349 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50897  predicted protein  33.2 
 
 
504 aa  241  1e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.406866 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82041  predicted protein  38.62 
 
 
664 aa  238  2e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30814  predicted protein  37.15 
 
 
503 aa  233  4.0000000000000004e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.018903  normal  0.204154 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06571  alpha-1,2-mannosyltransferase (Mnn2), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04450)  31.98 
 
 
509 aa  200  5e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00193217  normal  0.120409 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06857  alpha-1,2-mannosyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13090)  33.75 
 
 
490 aa  181  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.110194 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62462  predicted protein  31.87 
 
 
726 aa  163  5.0000000000000005e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13927  predicted protein  29.9 
 
 
277 aa  70.5  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00120  expressed protein  26.1 
 
 
731 aa  62.4  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.189279  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00170  expressed protein  28.81 
 
 
529 aa  55.1  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0350472  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52586  mannosyltransferase  23.44 
 
 
759 aa  51.2  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0328138 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82608  mannosyltransferase  22.54 
 
 
802 aa  48.9  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.923251  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>