25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_50569 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009048  PICST_50569  potential iron permease membrane protein  100 
 
 
383 aa  775    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0122475  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54152  iron permease  46.72 
 
 
433 aa  343  2e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.59997  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64944  plasma membrane iron permease  46.94 
 
 
379 aa  304  1.0000000000000001e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68095  plasma membrane iron permease  43.77 
 
 
385 aa  288  1e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0111096 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02430  conserved hypothetical protein  38.71 
 
 
441 aa  257  2e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.190036  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05700  high-affinity iron permease CaFTR1, putative  35.54 
 
 
433 aa  257  2e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0488231  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01920  iron ion transporter, putative  34.44 
 
 
466 aa  194  2e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.37561  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1811  iron permease FTR1  20.77 
 
 
283 aa  61.2  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.668278 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2597  Iron permease FTR1  22.05 
 
 
290 aa  58.9  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3143  iron permease FTR1  24.03 
 
 
281 aa  57.4  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2929  iron permease FTR1  20.39 
 
 
281 aa  57.4  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00359497  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1789  iron permease FTR1  21.29 
 
 
315 aa  53.9  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3596  hypothetical protein  21.15 
 
 
284 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1733  iron permease FTR1  21.79 
 
 
304 aa  50.4  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.997501  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3859  iron permease FTR1  23.11 
 
 
280 aa  50.4  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.627947  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3314  iron permease FTR1  31.37 
 
 
281 aa  49.3  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1952  iron permease FTR1  26.89 
 
 
304 aa  47  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.495146  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2612  iron permease FTR1  25.14 
 
 
308 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000110205  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3198  iron permease FTR1  29.09 
 
 
280 aa  47  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.521431  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1545  FTR1 family protein  19.35 
 
 
277 aa  46.6  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.884821  normal  0.11427 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2872  Iron permease FTR1  29.21 
 
 
279 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.121627  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2602  iron permease FTR1  27.62 
 
 
239 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000455168  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3367  Iron permease FTR1  21.97 
 
 
284 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226405  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1763  Iron permease FTR1  22.1 
 
 
315 aa  43.1  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2366  iron permease FTR1  21.15 
 
 
282 aa  42.7  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0450502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>