14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_54152 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_54152  iron permease  100 
 
 
433 aa  884    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.59997  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50569  potential iron permease membrane protein  47.34 
 
 
383 aa  369  1e-101  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0122475  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64944  plasma membrane iron permease  43.57 
 
 
379 aa  305  8.000000000000001e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68095  plasma membrane iron permease  49.19 
 
 
385 aa  299  6e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0111096 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05700  high-affinity iron permease CaFTR1, putative  34.68 
 
 
433 aa  265  1e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0488231  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02430  conserved hypothetical protein  35.7 
 
 
441 aa  258  2e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.190036  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01920  iron ion transporter, putative  32.87 
 
 
466 aa  207  4e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.37561  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2597  Iron permease FTR1  22.84 
 
 
290 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2929  iron permease FTR1  21.76 
 
 
281 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00359497  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2875  iron permease FTR1  27.16 
 
 
280 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2872  Iron permease FTR1  21.15 
 
 
279 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.121627  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1789  iron permease FTR1  21.65 
 
 
315 aa  44.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3367  Iron permease FTR1  22.3 
 
 
284 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226405  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3143  iron permease FTR1  22.12 
 
 
281 aa  43.1  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>