17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_50523 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009048  PICST_50523  predicted protein  100 
 
 		 153 aa  307  2.9999999999999997e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.441428  normal  0.351185 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07682  AP-1 adaptor complex subunit sigma, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01570)  70.55 
 
 		 156 aa  219  9.999999999999999e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.651309  normal  0.358442 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04240  conserved hypothetical protein  58.28 
 
 		 164 aa  195  2.0000000000000003e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26214  predicted protein  49.29 
 
 		 155 aa  159  1e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15237  normal  0.397861 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_54935  predicted protein  45.7 
 
 		 152 aa  137  6e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00722  AP-2 complex subunit sigma (Sigma2-adaptin)(Adaptin small chain)(Clathrin assembly protein 2 small chain) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BFF8]  49.66 
 
 		 145 aa  137  6e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.269069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40610  predicted protein  42.25 
 
 		 143 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.119442  normal  0.0353096 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01420  vesicle-mediated transport-related protein, putative  48.97 
 
 		 215 aa  133  8e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36149  predicted protein  46.38 
 
 		 202 aa  127  4.0000000000000003e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86644  predicted protein  47.92 
 
 		 145 aa  127  6e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.339516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_54718  predicted protein  39.44 
 
 		 157 aa  119  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26258  predicted protein  37.8 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.709266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14536  predicted protein  33.11 
 
 		 150 aa  94.7  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28054  predicted protein  29.73 
 
 		 160 aa  89.4  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.066003 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00710  Golgi to vacuole transport-related protein, putative  26.95 
 
 		 220 aa  89.4  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05519  AP-3 adaptor complex subunit sigma, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13020)  28.21 
 
 		 185 aa  86.3  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.198267 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55999  predicted protein  27.91 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.226774 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>