17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE04240 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006687  CNE04240  conserved hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  335  9.999999999999999e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07682  AP-1 adaptor complex subunit sigma, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01570)  69.93 
 
 
156 aa  237  5e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.651309  normal  0.358442 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50523  predicted protein  58.28 
 
 
153 aa  195  2.0000000000000003e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.441428  normal  0.351185 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26214  predicted protein  47.74 
 
 
155 aa  166  1e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15237  normal  0.397861 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00722  AP-2 complex subunit sigma (Sigma2-adaptin)(Adaptin small chain)(Clathrin assembly protein 2 small chain) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BFF8]  50 
 
 
145 aa  147  6e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.269069  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40610  predicted protein  45.45 
 
 
143 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.119442  normal  0.0353096 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_54935  predicted protein  45.75 
 
 
152 aa  142  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01420  vesicle-mediated transport-related protein, putative  49.62 
 
 
215 aa  142  3e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86644  predicted protein  49.3 
 
 
145 aa  141  4e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.339516  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36149  predicted protein  42.21 
 
 
202 aa  131  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26258  predicted protein  39.42 
 
 
144 aa  115  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.709266  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_54718  predicted protein  33.57 
 
 
157 aa  112  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28054  predicted protein  37.32 
 
 
160 aa  103  7e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.066003 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05519  AP-3 adaptor complex subunit sigma, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13020)  31.69 
 
 
185 aa  100  8e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.198267 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14536  predicted protein  34 
 
 
150 aa  100  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00710  Golgi to vacuole transport-related protein, putative  32.32 
 
 
220 aa  97.1  9e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55999  predicted protein  34.33 
 
 
159 aa  78.2  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.226774 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>