17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_40610 on replicon NC_009369
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009369  OSTLU_40610  predicted protein  100 
 
 
143 aa  290  4e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.119442  normal  0.0353096 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_54935  predicted protein  60.53 
 
 
152 aa  197  3e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01420  vesicle-mediated transport-related protein, putative  65.49 
 
 
215 aa  197  6e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00722  AP-2 complex subunit sigma (Sigma2-adaptin)(Adaptin small chain)(Clathrin assembly protein 2 small chain) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BFF8]  61.81 
 
 
145 aa  189  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.269069  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86644  predicted protein  52.45 
 
 
145 aa  151  4e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.339516  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04240  conserved hypothetical protein  45.45 
 
 
164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07682  AP-1 adaptor complex subunit sigma, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01570)  43.66 
 
 
156 aa  140  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.651309  normal  0.358442 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50523  predicted protein  42.25 
 
 
153 aa  135  2e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.441428  normal  0.351185 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26214  predicted protein  46.58 
 
 
155 aa  133  8e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15237  normal  0.397861 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_54718  predicted protein  42.18 
 
 
157 aa  119  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36149  predicted protein  41.3 
 
 
202 aa  111  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26258  predicted protein  43.2 
 
 
144 aa  110  6e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.709266  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28054  predicted protein  33.56 
 
 
160 aa  89.4  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.066003 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14536  predicted protein  35.1 
 
 
150 aa  87.4  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05519  AP-3 adaptor complex subunit sigma, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13020)  31.25 
 
 
185 aa  85.9  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.198267 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00710  Golgi to vacuole transport-related protein, putative  33.54 
 
 
220 aa  83.6  8e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55999  predicted protein  36.22 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.226774 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>