17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNN01420 on replicon NC_006683
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006683  CNN01420  vesicle-mediated transport-related protein, putative  100 
 
 		 215 aa  441  1e-123  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00722  AP-2 complex subunit sigma (Sigma2-adaptin)(Adaptin small chain)(Clathrin assembly protein 2 small chain) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BFF8]  81.94 
 
 		 145 aa  249  2e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.269069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40610  predicted protein  65.49 
 
 		 143 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.119442  normal  0.0353096 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_54935  predicted protein  61.44 
 
 		 152 aa  195  5.000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86644  predicted protein  58.45 
 
 		 145 aa  171  5.999999999999999e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.339516  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04240  conserved hypothetical protein  49.62 
 
 		 164 aa  141  6e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26214  predicted protein  50.76 
 
 		 155 aa  137  7.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15237  normal  0.397861 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50523  predicted protein  48.97 
 
 		 153 aa  133  1.9999999999999998e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.441428  normal  0.351185 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07682  AP-1 adaptor complex subunit sigma, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01570)  46.97 
 
 		 156 aa  131  6.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.651309  normal  0.358442 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_54718  predicted protein  39.19 
 
 		 157 aa  104  9e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26258  predicted protein  43.65 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.709266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36149  predicted protein  45.32 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28054  predicted protein  36.49 
 
 		 160 aa  97.1  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.066003 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05519  AP-3 adaptor complex subunit sigma, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13020)  33.56 
 
 		 185 aa  90.1  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.198267 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14536  predicted protein  38.73 
 
 		 150 aa  87.8  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00710  Golgi to vacuole transport-related protein, putative  33.94 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55999  predicted protein  35.43 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.226774 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>