52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_35527 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_35527  succinate dehydrogenase  100 
 
 		 160 aa  324  3e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.243811  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03530  succinate dehydrogenase (ubiquinone), putative  50 
 
 		 221 aa  136  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.462148  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08793  Cytochrome B-560 subunit of succinate dehydrogenasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ASD7]  38.12 
 
 		 191 aa  125  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0953988 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1332  succinate dehydrogenase subunit C  40.35 
 
 		 130 aa  77  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.956048 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0046  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  38.17 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.200427  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1879  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  40.37 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.554321  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1221  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  40.91 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18516  succinate dehydrogenase cytochrome b subunit  29.75 
 
 		 167 aa  67  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0149208  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3021  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  31.62 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3565  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  37.14 
 
 		 131 aa  60.5  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0378  succinate dehydrogenase membrane anchor subunit  33.64 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0086  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  36.44 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.745035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2798  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  35.19 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0974  succinate dehydrogenase subunit C  33.9 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1535  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  32.03 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0342  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  30.91 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2634  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  33.9 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3692  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  39.62 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3980  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  39.62 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.350999 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2867  putative succinate dehydrogenase cytochrome b subunit  33.87 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0811  succinate dehydrogenase subunit C  34.71 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.609533 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0951  succinate dehydrogenase cytochrome b556 subunit  32.35 
 
 		 132 aa  57  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.91234  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1904  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  34.62 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1967  succinate dehydrogenase cytochrome b556 subunit  37.37 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124029 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0189  succinate dehydrogenase subunit C  31.2 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2751  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  35.51 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1832  succinate dehydrogenase, cytochrome B subunit  34.62 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.725413  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7246  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  36.45 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.786807  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1548  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit, putative  35.85 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.868422  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6038  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  33.01 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0457  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  36.46 
 
 		 133 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3616  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  34.65 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0175322  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4276  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  35.42 
 
 		 133 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.655158  normal  0.991601 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2959  succinate dehydrogenase cytochrome b556 subunit  36.19 
 
 		 130 aa  52  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0396146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0918  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  31.4 
 
 		 128 aa  51.2  0.000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.798189  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0218  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  29.52 
 
 		 132 aa  51.2  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3525  succinate dehydrogenase subunit C  32.73 
 
 		 127 aa  50.8  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2848  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  31 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3600  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  32.99 
 
 		 133 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0757766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3892  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  32.99 
 
 		 133 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0481  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  30.39 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.376521  normal  0.74591 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3246  succinate dehydrogenase subunit C  31.45 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0088  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  33.98 
 
 		 133 aa  47.8  0.00007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0327  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  30.77 
 
 		 132 aa  47.4  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4137  succinate dehydrogenase cytochrome B-556 subunit  34.29 
 
 		 130 aa  47.4  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0072  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  28.71 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0567  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  28.23 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.592184  normal  0.0786377 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1213  succinate dehydrogenase subunit C  30.58 
 
 		 125 aa  44.3  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.101411  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1744  succinate dehydrogenase subunit C  32.38 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.807466  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1202  succinate dehydrogenase subunit C  30.25 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.824011  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1433  succinate dehydrogenase cytochrome b556 subunit  28.71 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0047  succinate dehydrogenase, cytochrome b556 subunit  29.06 
 
 		 140 aa  41.2  0.006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>