15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_32483 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_32483  predicted protein  100 
 
 
655 aa  1348    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0241733  normal  0.371537 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00556  Meiotic recombination protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J0S5]  47.82 
 
 
818 aa  521  1e-146  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00700  meiotic DNA double-strand break processing-related protein, putative  39.92 
 
 
721 aa  365  1e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.880608  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43144  predicted protein  35.33 
 
 
542 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275751  normal  0.938333 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37287  Mre11 DNA repair/recombination protein  35.22 
 
 
806 aa  305  1.0000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.412163  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  23.66 
 
 
382 aa  57.4  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2438  metallophosphoesterase  26.39 
 
 
479 aa  48.5  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0370  metallophosphoesterase  28.57 
 
 
469 aa  47.4  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.976687  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0359  DNA repair protein  26.21 
 
 
776 aa  47.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.896103 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0182  metallophosphoesterase  24.74 
 
 
436 aa  46.6  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0854  metallophosphoesterase  25.21 
 
 
423 aa  46.6  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1724  nuclease SbcCD, D subunit, putative  22.22 
 
 
418 aa  45.8  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559554  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1032  nuclease SbcCD, D subunit  30.83 
 
 
372 aa  45.4  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0069  metallophosphoesterase  26.12 
 
 
381 aa  45.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  29.06 
 
 
390 aa  45.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>