17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE00700 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006687  CNE00700  meiotic DNA double-strand break processing-related protein, putative  100 
 
 
721 aa  1490    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.880608  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00556  Meiotic recombination protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J0S5]  45.42 
 
 
818 aa  440  9.999999999999999e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32483  predicted protein  39.19 
 
 
655 aa  379  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0241733  normal  0.371537 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37287  Mre11 DNA repair/recombination protein  35.13 
 
 
806 aa  328  2.0000000000000001e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.412163  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43144  predicted protein  36.41 
 
 
542 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275751  normal  0.938333 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2438  metallophosphoesterase  40.51 
 
 
479 aa  58.9  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0182  metallophosphoesterase  39.71 
 
 
436 aa  57  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  23.32 
 
 
382 aa  53.1  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  27.52 
 
 
414 aa  50.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2899  metallophosphoesterase  35.06 
 
 
421 aa  50.4  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.784914  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0370  metallophosphoesterase  32.47 
 
 
469 aa  49.3  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.976687  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1502  metallophosphoesterase  38.89 
 
 
485 aa  47.8  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  34.72 
 
 
390 aa  47  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1032  nuclease SbcCD, D subunit  26.8 
 
 
372 aa  45.4  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  38.03 
 
 
387 aa  45.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0359  DNA repair protein  25.48 
 
 
776 aa  45.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.896103 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1789  metallophosphoesterase  30.67 
 
 
409 aa  44.7  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>