15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_37287 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_37287  Mre11 DNA repair/recombination protein  100 
 
 		 806 aa  1659    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.412163  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00556  Meiotic recombination protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J0S5]  40.54 
 
 		 818 aa  369  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43144  predicted protein  37.91 
 
 		 542 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275751  normal  0.938333 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00700  meiotic DNA double-strand break processing-related protein, putative  33.59 
 
 		 721 aa  336  7.999999999999999e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.880608  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32483  predicted protein  35.5 
 
 		 655 aa  318  2e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0241733  normal  0.371537 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  24.53 
 
 		 382 aa  55.8  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0182  metallophosphoesterase  42.03 
 
 		 436 aa  52.8  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1212  metallophosphoesterase  26.92 
 
 		 415 aa  49.3  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0359  DNA repair protein  38.57 
 
 		 776 aa  48.9  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.896103 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2438  metallophosphoesterase  39.71 
 
 		 479 aa  48.9  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0854  metallophosphoesterase  23.55 
 
 		 423 aa  47  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0301  metallophosphoesterase  31.36 
 
 		 386 aa  45.4  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0370  metallophosphoesterase  35.29 
 
 		 469 aa  45.4  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.976687  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  37.5 
 
 		 387 aa  45.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2899  metallophosphoesterase  36.23 
 
 		 421 aa  44.7  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.784914  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>