47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_44177 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_44174  5'-Nucleotidase or metallophosphoesterase  67.59 
 
 
1370 aa  870    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44177  predicted protein  100 
 
 
647 aa  1350    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.510803  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47436  predicted protein  25.54 
 
 
573 aa  89.7  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08461  metallophosphoesterase  23.68 
 
 
503 aa  79  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26712  predicted protein  25.97 
 
 
669 aa  74.3  0.000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.427563  normal  0.0500675 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2483  5'-nucleotidase  24.41 
 
 
512 aa  72.4  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1472  5'-nucleotidase  22.66 
 
 
505 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633021  normal  0.092078 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1472  5'-nucleotidase  22.27 
 
 
517 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.150971 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1750  5'-nucleotidase  22.13 
 
 
500 aa  67  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.398789 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0351  5'-Nucleotidase domain protein  27.01 
 
 
579 aa  65.5  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2582  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.97 
 
 
505 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.270196  normal  0.151429 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  19.72 
 
 
523 aa  62.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05655  5'-nucleotidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01160)  26.83 
 
 
498 aa  62  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.511883 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0770  hypothetical protein  24.22 
 
 
494 aa  59.7  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0435577  normal  0.251523 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0870  phosphatase/nucleotidase  26.94 
 
 
632 aa  58.2  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0599439  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4645  5'-Nucleotidase domain protein  21.84 
 
 
506 aa  57.8  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132836  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  24.58 
 
 
504 aa  57.4  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3565  5'-nucleotidase-like  23.21 
 
 
491 aa  57  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10661  5'-nucleotidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14310)  21.74 
 
 
666 aa  56.2  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3060  metallophosphoesterase  25.09 
 
 
460 aa  53.5  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1322  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase related esterase  24.54 
 
 
447 aa  53.1  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0286608  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  23.47 
 
 
659 aa  52.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  20.25 
 
 
530 aa  52  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.6 
 
 
627 aa  51.6  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  19.74 
 
 
523 aa  50.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.225236 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  24.23 
 
 
520 aa  50.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal  0.180073 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  21.21 
 
 
657 aa  50.8  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0038  5'-Nucleotidase domain protein  24.23 
 
 
520 aa  50.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0036  5'-Nucleotidase domain-containing protein  24.23 
 
 
523 aa  50.4  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0257777 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3996  metallophosphoesterase  23.11 
 
 
501 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1792  5'-Nucleotidase domain protein  24.75 
 
 
549 aa  49.3  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.96208  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1751  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.55 
 
 
553 aa  48.1  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000978587  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2912  metallophosphoesterase  26.47 
 
 
463 aa  48.1  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.27 
 
 
1284 aa  47.4  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  23.16 
 
 
1181 aa  47  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  23.53 
 
 
1175 aa  47  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0878  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase related esterase  24.09 
 
 
521 aa  46.2  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00446391  hitchhiker  0.0000191167 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  22.6 
 
 
663 aa  45.8  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01256  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.87 
 
 
553 aa  45.4  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0441  5'-Nucleotidase domain protein  25.23 
 
 
520 aa  45.8  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000373841  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0800  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  22.97 
 
 
553 aa  45.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2418  Ser/Thr protein phosphatase family protein  20.97 
 
 
724 aa  44.7  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  20.96 
 
 
518 aa  44.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4388  serine/threonine protein phosphatase family protein  22.49 
 
 
517 aa  44.3  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  20.96 
 
 
518 aa  44.3  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  20.76 
 
 
518 aa  43.9  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0186  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase related esterase  22.79 
 
 
446 aa  43.9  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>