23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_43857 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_43857  predicted protein  100 
 
 		 207 aa  427  1e-119  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0466833  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49876  predicted protein  44.56 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00416542  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  30.08 
 
 		 162 aa  50.1  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  28.78 
 
 		 163 aa  48.1  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  29.13 
 
 		 279 aa  47  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  29.05 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  30.63 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  28.91 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  27.78 
 
 		 166 aa  46.2  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  28.47 
 
 		 558 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  30.36 
 
 		 161 aa  46.2  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  29.85 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3070  beta-Ig-H3/fasciclin  34.62 
 
 		 354 aa  45.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201984  normal  0.916822 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  30.94 
 
 		 166 aa  44.3  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  30.13 
 
 		 164 aa  43.9  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  26.09 
 
 		 261 aa  43.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3372  beta-Ig-H3/fasciclin  27.93 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27077  predicted protein  31.09 
 
 		 143 aa  42.4  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.259215  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2869  beta-Ig-H3/fasciclin  28.22 
 
 		 238 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  27.61 
 
 		 156 aa  42  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  25.81 
 
 		 186 aa  41.6  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  26.87 
 
 		 156 aa  41.6  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2016  Beta-Ig-H3/fasciclin  26.28 
 
 		 139 aa  41.2  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921903  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>