17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_51897 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_51897  predicted protein  100 
 
 		 531 aa  1109    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65985  predicted protein  34.7 
 
 		 685 aa  358  9.999999999999999e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00221694  normal  0.861424 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_89076  predicted protein  36.73 
 
 		 684 aa  343  4e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0187985  normal  0.12809 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05450  rRNA processing-related protein, putative  33.92 
 
 		 770 aa  317  3e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0960397  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02077  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_2G04780)  32.89 
 
 		 728 aa  284  3.0000000000000004e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.530269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  22.92 
 
 		 1901 aa  51.6  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  25.45 
 
 		 1355 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00305  small nucleolar ribonucleoprotein complex subunit Dip2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02680)  22.45 
 
 		 963 aa  48.1  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.140894  normal  0.864535 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  26.06 
 
 		 565 aa  46.6  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3910  WD-40 repeat-containing protein  21.05 
 
 		 1152 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  23.42 
 
 		 1474 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  31 
 
 		 947 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  24.78 
 
 		 1217 aa  44.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  23.97 
 
 		 1190 aa  44.3  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  27.38 
 
 		 1213 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  27.78 
 
 		 1247 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 1807 aa  43.5  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>