26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47762 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_47762  predicted protein  100 
 
 
1014 aa  2107    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0307  hypothetical protein  39.62 
 
 
402 aa  253  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0067076  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0427  hypothetical protein  37.78 
 
 
416 aa  248  4.9999999999999997e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0723207 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1577  altronate oxidoreductase  27.48 
 
 
478 aa  64.7  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3848  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  24.61 
 
 
494 aa  52.4  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.611991  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2160  amidohydrolase 2  30.28 
 
 
431 aa  52.8  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00531061  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0581  mannitol dehydrogenase family protein  28.49 
 
 
489 aa  47.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.372441  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0508  mannitol dehydrogenase family protein  28.49 
 
 
498 aa  47.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184612  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3317  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.27 
 
 
431 aa  47.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0768  mannitol dehydrogenase family protein  28.49 
 
 
489 aa  47.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1646  mannitol dehydrogenase family protein  28.49 
 
 
489 aa  47.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  28.49 
 
 
489 aa  47.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2094  mannitol dehydrogenase family protein  28.49 
 
 
489 aa  47.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0692  mannitol dehydrogenase family protein  28.49 
 
 
489 aa  47.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340318  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  29.56 
 
 
491 aa  47  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2842  altronate oxidoreductase  24.03 
 
 
507 aa  46.2  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00101076  normal  0.0729645 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  24.63 
 
 
491 aa  45.8  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.69 
 
 
493 aa  45.4  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1006  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.56 
 
 
493 aa  45.4  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.128088 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3572  mannitol 2-dehydrogenase  25.43 
 
 
495 aa  45.4  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5060  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.31 
 
 
483 aa  45.4  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1622  hypothetical protein  21.52 
 
 
420 aa  45.4  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000236041  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2866  mannitol dehydrogenase-like  29.49 
 
 
503 aa  45.4  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540651  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4288  Mannitol dehydrogenase domain protein  30.77 
 
 
499 aa  45.1  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.760127 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1732  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.14 
 
 
477 aa  44.7  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.163277  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0096  mannitol dehydrogenase  31.14 
 
 
477 aa  44.7  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.027752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>