23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2160 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2160  amidohydrolase 2  100 
 
 		 431 aa  902    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00531061  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1622  hypothetical protein  25.55 
 
 		 420 aa  123  5e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000236041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0158  glucuronate isomerase  24.45 
 
 		 454 aa  83.6  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0415416  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0870  glucuronate isomerase  23.76 
 
 		 455 aa  75.9  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.452476  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4204  Glucuronate isomerase  21.9 
 
 		 454 aa  75.5  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.828755  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0879  Glucuronate isomerase  22.73 
 
 		 465 aa  67.8  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3197  glucuronate isomerase  23.22 
 
 		 491 aa  66.6  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.264634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0427  hypothetical protein  24.07 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0723207 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0307  hypothetical protein  23.28 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0067076  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3312  Glucuronate isomerase  22.12 
 
 		 468 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0386797 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0883  glucuronate isomerase  22.86 
 
 		 451 aa  55.1  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0860  glucuronate isomerase  23.04 
 
 		 451 aa  54.3  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47762  predicted protein  30.28 
 
 		 1014 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0502  glucuronate isomerase  22.15 
 
 		 467 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0836  hypothetical protein  21.69 
 
 		 192 aa  50.4  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2405  glucuronate isomerase  21.23 
 
 		 464 aa  48.9  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0100052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1602  glucuronate isomerase  19.47 
 
 		 463 aa  48.9  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0854  glucuronate isomerase  20.39 
 
 		 455 aa  48.9  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0587  Glucuronate isomerase  22.32 
 
 		 473 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.237114  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07080  glucuronate isomerase  23.76 
 
 		 475 aa  48.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.791965 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0787  glucuronate isomerase  21.35 
 
 		 474 aa  47  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4023  glucuronate isomerase  21.73 
 
 		 471 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.559414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03860  glucuronate isomerase  21.4 
 
 		 465 aa  44.3  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.089523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>