18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46239 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_46239  predicted protein  100 
 
 
778 aa  1611    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.514117  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46165  predicted protein  38.46 
 
 
272 aa  79.3  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50486  predicted protein  39.78 
 
 
173 aa  68.2  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46164  predicted protein  33.67 
 
 
460 aa  66.6  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47902  predicted protein  45.07 
 
 
197 aa  65.9  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.482005  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32692  predicted protein  34.34 
 
 
491 aa  63.5  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47900  predicted protein  35.05 
 
 
196 aa  63.9  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.841912  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47877  predicted protein  37.11 
 
 
257 aa  60.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.15469  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48944  predicted protein  34.88 
 
 
304 aa  59.7  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50283  predicted protein  27.39 
 
 
452 aa  58.2  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323556  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43681  predicted protein  25.87 
 
 
287 aa  57.4  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.709785  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39796  predicted protein  34.88 
 
 
173 aa  55.5  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49122  predicted protein  30.58 
 
 
1058 aa  54.7  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0406753  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44600  predicted protein  26.45 
 
 
271 aa  52  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.809364  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42870  predicted protein  35.14 
 
 
243 aa  50.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.442605  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38048  predicted protein  37.5 
 
 
240 aa  48.9  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261907  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48994  predicted protein  35.71 
 
 
382 aa  47.8  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.016903  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47876  predicted protein  37.31 
 
 
159 aa  47.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.154799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>