More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42406 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42406  predicted protein  100 
 
 
282 aa  584  1e-166  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0877311  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45443  predicted protein  76.16 
 
 
273 aa  451  1.0000000000000001e-126  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01805  Carbonic anhydrase (EC 4.2.1.1)(Carbonate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BCC5]  46.7 
 
 
264 aa  202  6e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.600285 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6530  Carbonate dehydratase  46.58 
 
 
221 aa  201  8e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460093  normal  0.148465 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0303  carbonate dehydratase  43.98 
 
 
216 aa  192  4e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.525447  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1138  Carbonate dehydratase  43.19 
 
 
218 aa  185  8e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.580584  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3268  Carbonate dehydratase  41.71 
 
 
209 aa  179  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.352199 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2930  Carbonate dehydratase  38.31 
 
 
215 aa  170  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0643  Carbonate dehydratase  36.56 
 
 
223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4763  carbonate dehydratase  39.15 
 
 
211 aa  162  8.000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755783  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3483  carbonic anhydrase  38.19 
 
 
199 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.343954  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1369  Carbonate dehydratase  39.2 
 
 
206 aa  158  9e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.683056 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1754  carbonate dehydratase  42.68 
 
 
210 aa  158  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2858  carbonate dehydratase  36.45 
 
 
207 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2395  dihydroorotase homodimeric type  39.9 
 
 
209 aa  155  8e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.316907  normal  0.063783 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0277  carbonic anhydrase protein  40.1 
 
 
226 aa  155  9e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101994  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5382  putative carbonic anhydrase  37.61 
 
 
215 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4665  Carbonate dehydratase  37.56 
 
 
209 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1041  carbonate dehydratase (carbonic anhydrase)  39.05 
 
 
212 aa  152  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.151449  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1811  carbonate dehydratase  38.78 
 
 
201 aa  152  7e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00306121  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2421  carbonate dehydratase  37.13 
 
 
204 aa  151  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.658807  decreased coverage  0.000000897123 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0127  Carbonate dehydratase  38.58 
 
 
226 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0135  Carbonate dehydratase  38.58 
 
 
226 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2596  Carbonate dehydratase  37.31 
 
 
220 aa  151  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151258  normal  0.378658 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3086  beta carbonic anhydrase  37.67 
 
 
256 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1859  carbonate dehydratase  37.19 
 
 
203 aa  150  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0117896  unclonable  0.00000151742 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0095  beta carbonic anhydrase  37.67 
 
 
256 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0580  carbonic anhydrase  37.67 
 
 
256 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2278  beta carbonic anhydrase  37.67 
 
 
256 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2009  beta carbonic anhydrase  37.67 
 
 
256 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0397  carbonic anhydrase  37.67 
 
 
256 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0418  putative carbonic anhydrase  37.67 
 
 
256 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.502533  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61860  putative carbonic anhydrase  37.16 
 
 
215 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0165234 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2056  carbonate dehydratase  37.69 
 
 
213 aa  150  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.106365  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1988  carbonate dehydratase  37 
 
 
204 aa  149  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.510163  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1762  carbonate dehydratase  36.5 
 
 
204 aa  149  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00095735  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5764  carbonic anhydrase  38.58 
 
 
219 aa  148  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625741  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0788  carbonic anhydrase  36 
 
 
219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.969871  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2185  carbonate dehydratase  37.19 
 
 
203 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000305693  hitchhiker  0.00975716 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1854  carbonate dehydratase  38 
 
 
201 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119541  decreased coverage  0.000000000969176 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0345  beta carbonic anhydrase  36.24 
 
 
250 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0731  Carbonate dehydratase  33.79 
 
 
380 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1642  carbonate dehydratase  36 
 
 
203 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00101631  normal  0.513692 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0099  GCN5-related N-acetyltransferase:carbonic anhydrase  35.07 
 
 
387 aa  146  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.609712  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2124  carbonate dehydratase  38 
 
 
201 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0724956  hitchhiker  0.000201034 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1442  carbonic anhydrase  37.82 
 
 
214 aa  144  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00323466  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2171  Carbonate dehydratase  35.68 
 
 
200 aa  144  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.485129  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0137  carbonate dehydratase  35.81 
 
 
223 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0378  carbonate dehydratase  34.23 
 
 
261 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  normal  0.578171 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2313  carbonate dehydratase  35.48 
 
 
255 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2942  carbonate dehydratase  35.48 
 
 
255 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.908215 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2927  carbonate dehydratase  35.48 
 
 
255 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4077  Carbonate dehydratase  36.68 
 
 
215 aa  143  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2976  carbonate dehydratase  35.32 
 
 
256 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2474  carbonic anhydrase family protein  38 
 
 
201 aa  142  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2828  carbonic anhydrase  34.65 
 
 
212 aa  142  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.63838  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0105  carbonic anhydrase  36.55 
 
 
223 aa  142  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2839  carbonate dehydratase  34.68 
 
 
256 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.66431 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6270  carbonate dehydratase  34.86 
 
 
255 aa  142  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2126  carbonate dehydratase  35.5 
 
 
205 aa  142  7e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.101359  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4254  putative carbonic anhydrase  35.32 
 
 
258 aa  142  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22351 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4260  carbonate dehydratase  34.85 
 
 
196 aa  142  9e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1023  carbonic anhydrase  34.65 
 
 
213 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.76145  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2475  carbonate dehydratase  35.5 
 
 
205 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000508683  hitchhiker  0.00965957 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0118  putative carbonic anhydrase  36.45 
 
 
222 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1987  Carbonate dehydratase  35.5 
 
 
205 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142238  hitchhiker  0.00000000100823 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2360  carbonate dehydratase  35.5 
 
 
205 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000972016  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1909  carbonic anhydrase  36.5 
 
 
201 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0250293  hitchhiker  0.00000107461 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2372  carbonate dehydratase  35.5 
 
 
205 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000458003  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0462  Carbonate dehydratase  35.96 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4773  carbonic anhydrase  36.36 
 
 
214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.115077 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1903  carbonate dehydratase  34.31 
 
 
220 aa  139  4.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1746  Carbonate dehydratase  37.5 
 
 
221 aa  139  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0859  carbonate dehydratase  34.63 
 
 
212 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1969  carbonate dehydratase  34.31 
 
 
220 aa  139  6e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.8834  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3369  carbonate dehydratase  34.22 
 
 
223 aa  139  7e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.690918 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1155  carbonic anhydrase  33.99 
 
 
213 aa  139  7e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.364048  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3123  carbonic anhydrase  33.99 
 
 
213 aa  138  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0390  carbonate dehydratase  35.05 
 
 
209 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.286988  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0421  carbonate dehydratase  34.88 
 
 
218 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002555  carbonic anhydrase  34.98 
 
 
222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.997557  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0994  carbonic anhydrase  34.15 
 
 
212 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0530644  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03457  carbonic anhydrase  35.47 
 
 
222 aa  136  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2421  carbonate dehydratase  33.99 
 
 
210 aa  135  8e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.011546 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0134  carbonic anhydrase  33.99 
 
 
220 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3997  carbonate dehydratase  33.5 
 
 
218 aa  134  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0179  carbonate dehydratase  36.55 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.420531  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0739  carbonic anhydrase  34 
 
 
211 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1874  Carbonate dehydratase  32.39 
 
 
217 aa  133  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1874  carbonate dehydratase  34.1 
 
 
227 aa  133  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202594  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1943  carbonate dehydratase  38.58 
 
 
225 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2030  carbonate dehydratase  40 
 
 
221 aa  132  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.177526  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2574  carbonate dehydratase  34.52 
 
 
217 aa  132  6.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107724  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00125  carbonic anhydrase  33.5 
 
 
220 aa  132  9e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3476  Carbonate dehydratase  33.5 
 
 
220 aa  132  9e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0128  carbonic anhydrase  33.5 
 
 
220 aa  132  9e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0136  carbonic anhydrase  33.5 
 
 
220 aa  132  9e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0130  carbonic anhydrase  33.5 
 
 
220 aa  132  9e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.79719  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3533  carbonic anhydrase  33.5 
 
 
220 aa  132  9e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00124  hypothetical protein  33.5 
 
 
220 aa  132  9e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>