29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_35370 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_35370  predicted protein  100 
 
 
487 aa  1014    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_55029  predicted protein  30.19 
 
 
324 aa  72.8  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2167  carbonic anhydrase  35.9 
 
 
258 aa  52  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  0.0204044 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4422  carbonate dehydratase  34.62 
 
 
244 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000131001  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0412  carbonate dehydratase  43.64 
 
 
245 aa  51.2  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.289569  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0238  Carbonate dehydratase  33.33 
 
 
244 aa  50.8  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1545  carbonate dehydratase  35.53 
 
 
315 aa  50.1  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0242  carbonic anhydrase  33.33 
 
 
244 aa  50.1  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0975  Carbonate dehydratase  36 
 
 
436 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3698  carbonate dehydratase  22.75 
 
 
246 aa  49.3  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1004  carbonic anhydrase  36 
 
 
436 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0144  virulence-associated E family protein  33.66 
 
 
812 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856396 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1056  carbonic anhydrase precursor  35.96 
 
 
235 aa  48.1  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0957  carbonic anhydrase  41.3 
 
 
239 aa  46.6  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000379553  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0758  carbonate dehydratase  38.3 
 
 
250 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.415587  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0578  Carbonate dehydratase  47.5 
 
 
246 aa  45.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000218816  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3166  Carbonate dehydratase  47.73 
 
 
258 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2952  carbonic anhydrase  47.73 
 
 
258 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3922  carbonic anhydrase  35.9 
 
 
481 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000779  carbonic anhydrase  36.54 
 
 
239 aa  44.7  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0030  carbonate dehydratase  35.71 
 
 
249 aa  43.9  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.123729  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1236  carbonate dehydratase  32.1 
 
 
252 aa  43.9  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3535  Carbonate dehydratase  36.36 
 
 
440 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169565 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2228  carbonate dehydratase  41.86 
 
 
249 aa  43.5  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103862  normal  0.0736818 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3753  carbonate dehydratase  34.25 
 
 
247 aa  43.5  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.405965 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0862  Carbonate dehydratase  47.22 
 
 
252 aa  43.1  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6140  carbonate dehydratase  32.76 
 
 
249 aa  43.1  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0238  carbonic anhydrase  33.33 
 
 
213 aa  43.1  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2989  carbonic anhydrase  39.58 
 
 
267 aa  43.1  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0923119  normal  0.0164403 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>