47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_55029 on replicon NC_011689
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011689  PHATRDRAFT_55029  predicted protein  100 
 
 
324 aa  670    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2952  carbonic anhydrase  28.01 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3166  Carbonate dehydratase  27.66 
 
 
258 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35370  predicted protein  30.19 
 
 
487 aa  73.9  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05086  carbonic anhydrase  26.23 
 
 
241 aa  72  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1480  carbonate dehydratase  27.97 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.551291  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0785  carbonate dehydratase  28.87 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.853738 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0791  carbonic anhydrase (carbonate dehydratase)  29.2 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00959218 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000779  carbonic anhydrase  25.16 
 
 
239 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3922  carbonic anhydrase  27.85 
 
 
481 aa  67.4  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0975  Carbonate dehydratase  29.63 
 
 
436 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1004  carbonic anhydrase  29.63 
 
 
436 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1545  carbonate dehydratase  25.35 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4625  carbonate dehydratase  27.08 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0359  carbonate dehydratase  33.12 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4422  carbonate dehydratase  28.5 
 
 
244 aa  65.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000131001  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2660  carbonate dehydratase  27.42 
 
 
255 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0379533  normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0973  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 
264 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0132613  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0862  Carbonate dehydratase  26.8 
 
 
252 aa  62.4  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2853  Carbonate dehydratase  27.24 
 
 
256 aa  62  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001220  carbonic anhydrase  24.84 
 
 
239 aa  62.4  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2228  carbonate dehydratase  24.26 
 
 
249 aa  62.4  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103862  normal  0.0736818 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0758  carbonate dehydratase  28.34 
 
 
250 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.415587  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3200  carbonate dehydratase  29.61 
 
 
259 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4960  carbonate dehydratase  29.61 
 
 
259 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1056  carbonic anhydrase precursor  25.19 
 
 
235 aa  58.5  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2167  carbonic anhydrase  25.09 
 
 
258 aa  58.5  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  0.0204044 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1132  carbonate dehydratase  24.56 
 
 
315 aa  57  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0536643  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0238  carbonic anhydrase  24.16 
 
 
213 aa  57  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4235  carbonate dehydratase  29.94 
 
 
259 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355304  normal  0.29806 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3698  carbonate dehydratase  25.83 
 
 
246 aa  56.2  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2989  carbonic anhydrase  25.57 
 
 
267 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0923119  normal  0.0164403 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0030  carbonate dehydratase  26.5 
 
 
249 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.123729  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3753  carbonate dehydratase  25.59 
 
 
247 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.405965 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1236  carbonate dehydratase  24.28 
 
 
252 aa  54.3  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1388  carbonate dehydratase  25.97 
 
 
237 aa  53.1  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000301506  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0412  carbonate dehydratase  22.86 
 
 
245 aa  52.8  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.289569  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6140  carbonate dehydratase  23.01 
 
 
249 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3535  Carbonate dehydratase  27 
 
 
440 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169565 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2073  carbonic anhydrase  25.81 
 
 
207 aa  50.4  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.495704  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0957  carbonic anhydrase  21.34 
 
 
239 aa  49.7  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000379553  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0242  carbonic anhydrase  25.51 
 
 
244 aa  49.3  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1725  carbonate dehydratase  26.67 
 
 
259 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0238  Carbonate dehydratase  24.49 
 
 
244 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0512  carbonate dehydratase  27.98 
 
 
370 aa  46.2  0.0009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0845304 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3462  carbonic anhydrase  23.77 
 
 
614 aa  45.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0578  Carbonate dehydratase  20.97 
 
 
246 aa  42.7  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000218816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>