28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_15913 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011690  PHATRDRAFT_15913  predicted protein  100 
 
 
107 aa  227  5e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15937  predicted protein  88.64 
 
 
154 aa  156  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.669488  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32740  histone methyltransferase involved in gene regulation  45.45 
 
 
1055 aa  87.8  5e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05795  Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-4 specific (EC 2.1.1.43)(COMPASS component SET1)(SET domain-containing protein 1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0Y5]  48.31 
 
 
1220 aa  85.1  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000000960866 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21456  predicted protein  42.86 
 
 
141 aa  70.1  0.000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00440745  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03610  conserved hypothetical protein  40.91 
 
 
1469 aa  67  0.00000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.199179  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14486  predicted protein  39.08 
 
 
1782 aa  59.7  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00353687  normal  0.194877 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6915  predicted protein  35.71 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08825  Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-36 specific (EC 2.1.1.43)(SET domain-containing protein 2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ASA5]  34.07 
 
 
980 aa  52  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.10745  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18587  predicted protein  33.75 
 
 
860 aa  49.7  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00809953  hitchhiker  0.00803603 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31672  predicted protein  36.84 
 
 
732 aa  48.1  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.418717 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16584  predicted protein  34.78 
 
 
495 aa  47  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03810  histone-lysine N-methyltransferase, putative  31.52 
 
 
834 aa  47  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_6698  predicted protein  28.41 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0731  nuclear protein SET  35.71 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0820  hypothetical protein  35.71 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0883  nuclear protein SET  29.63 
 
 
252 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0228  nuclear protein SET  35 
 
 
179 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000325788 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4628  nuclear protein SET  34.33 
 
 
184 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01981  nuclear protein SET  36.99 
 
 
155 aa  44.7  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360557  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1003  nuclear protein SET  37.14 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.285499 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3991  nuclear protein SET  32.84 
 
 
213 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.183073 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5201  Histone-lysine N-methyltransferase  30 
 
 
210 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0501783  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19163  predicted protein  30.67 
 
 
503 aa  41.6  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17948  predicted protein  30.67 
 
 
503 aa  41.6  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5473  histone-lysine N-methyltransferase  31.76 
 
 
230 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0414751  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3340  nuclear protein SET  32.84 
 
 
213 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3176  nuclear protein SET  31.34 
 
 
163 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.790185  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>