28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0543 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0543  transcriptional regulator, putative  100 
 
 		 67 aa  138  3e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1203  transcriptional regulator, putative  53.62 
 
 		 69 aa  79  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.48575 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2560  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 73 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2935  hypothetical protein  45.31 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.111213 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4109  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 71 aa  55.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0516586  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1362  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 69 aa  50.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120479 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  35.94 
 
 		 476 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 432 aa  44.3  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0152  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2254  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 482 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11150  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00242881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4372  helix-turn-helix domain-containing protein  30.51 
 
 		 87 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0153789  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3931  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 253 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1035  transcriptional regulator, XRE family  46.03 
 
 		 75 aa  41.2  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 224 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1573  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1118  putative transcriptional regulator  34 
 
 		 213 aa  40.8  0.006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1497  XRE family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.764708  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4290  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34926  normal  0.146409 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2986  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 483 aa  40.8  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.199434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2371  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 165 aa  40.8  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02797  helix-turn-helix, putative  33.85 
 
 		 62 aa  40.4  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1096  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 483 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0894  transcriptional regulator  34 
 
 		 215 aa  40.8  0.007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4879  transcriptional regulator, XRE family  31.75 
 
 		 480 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80038  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0020  transcriptional regulator  32.2 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.555038 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 252 aa  40  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>