20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2404 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2404  DGQHR domain protein  100 
 
 		 422 aa  877    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3764  DGQHR domain protein  30.14 
 
 		 409 aa  150  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0746  hypothetical protein  23.12 
 
 		 355 aa  88.6  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000170562  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2460  DGQHR domain protein  24.06 
 
 		 400 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0189337 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0738  hypothetical protein  22.98 
 
 		 375 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677838  normal  0.0727241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4839  DGQHR domain protein  23.92 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.512859 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2305  hypothetical protein  26.42 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.468851  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2473  hypothetical protein  22.46 
 
 		 358 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0472  hypothetical protein  21.08 
 
 		 361 aa  77.8  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.772417 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4573  hypothetical protein  23.37 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.278248  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1367  DNA sulfur modification protein DndB  21.79 
 
 		 380 aa  75.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0012  hypothetical protein  23.92 
 
 		 375 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0170  DNA sulfur modification protein DndB  20.42 
 
 		 372 aa  69.3  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0360  hypothetical protein  22.64 
 
 		 380 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.102743  decreased coverage  0.00986478 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2571  hypothetical protein  23.67 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000749327  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1849  hypothetical protein  24.32 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00226909  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3403  hypothetical protein  24.32 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0834  hypothetical protein  19.63 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4837  DGQHR domain protein  25.24 
 
 		 249 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.564526 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2646  hypothetical protein  28.17 
 
 		 347 aa  44.7  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>