18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4837 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4837  DGQHR domain protein  100 
 
 
249 aa  507  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.564526 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0738  hypothetical protein  50.7 
 
 
375 aa  223  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677838  normal  0.0727241 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0012  hypothetical protein  49.3 
 
 
375 aa  222  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2473  hypothetical protein  44.92 
 
 
358 aa  218  6e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0170  DNA sulfur modification protein DndB  43.93 
 
 
372 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0834  hypothetical protein  39.58 
 
 
364 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1367  DNA sulfur modification protein DndB  46.08 
 
 
380 aa  211  7e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0472  hypothetical protein  42.92 
 
 
361 aa  208  7e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.772417 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2305  hypothetical protein  42.44 
 
 
369 aa  208  7e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.468851  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0360  hypothetical protein  39.92 
 
 
380 aa  198  6e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.102743  decreased coverage  0.00986478 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4573  hypothetical protein  40.34 
 
 
370 aa  198  6e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.278248  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0746  hypothetical protein  37.86 
 
 
355 aa  173  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000170562  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2571  hypothetical protein  23.87 
 
 
354 aa  95.1  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000749327  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1849  hypothetical protein  24.22 
 
 
354 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00226909  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3403  hypothetical protein  24.22 
 
 
354 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3764  DGQHR domain protein  27.07 
 
 
409 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2404  DGQHR domain protein  25.24 
 
 
422 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4839  DGQHR domain protein  23.42 
 
 
391 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.512859 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>