20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4573 on replicon NC_008244
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008244  Meso_4573  hypothetical protein  100 
 
 
370 aa  752    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.278248  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0360  hypothetical protein  49.18 
 
 
380 aa  367  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.102743  decreased coverage  0.00986478 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1367  DNA sulfur modification protein DndB  45.26 
 
 
380 aa  354  1e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0170  DNA sulfur modification protein DndB  49.86 
 
 
372 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2473  hypothetical protein  46.35 
 
 
358 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0834  hypothetical protein  41.67 
 
 
364 aa  316  3e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0012  hypothetical protein  45.91 
 
 
375 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0738  hypothetical protein  44.51 
 
 
375 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677838  normal  0.0727241 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2305  hypothetical protein  41.6 
 
 
369 aa  310  2e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.468851  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0472  hypothetical protein  42.57 
 
 
361 aa  310  2e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.772417 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0746  hypothetical protein  41.79 
 
 
355 aa  281  1e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000170562  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4837  DGQHR domain protein  40.34 
 
 
249 aa  199  9e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.564526 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2571  hypothetical protein  25.41 
 
 
354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000749327  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3403  hypothetical protein  25.41 
 
 
354 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1849  hypothetical protein  25.14 
 
 
354 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00226909  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2404  DGQHR domain protein  23.28 
 
 
422 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3764  DGQHR domain protein  25.36 
 
 
409 aa  53.5  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2460  DGQHR domain protein  25.43 
 
 
400 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0189337 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2462  DGQHR domain protein  24.51 
 
 
534 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0224469 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4839  DGQHR domain protein  25 
 
 
391 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.512859 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>