12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4839 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4839  DGQHR domain protein  100 
 
 
391 aa  811    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.512859 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2460  DGQHR domain protein  66.92 
 
 
400 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0189337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3764  DGQHR domain protein  22.92 
 
 
409 aa  92.8  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2404  DGQHR domain protein  23.92 
 
 
422 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0738  hypothetical protein  22.19 
 
 
375 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677838  normal  0.0727241 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0472  hypothetical protein  20.71 
 
 
361 aa  53.1  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.772417 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0746  hypothetical protein  20.56 
 
 
355 aa  51.6  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000170562  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0170  DNA sulfur modification protein DndB  20.27 
 
 
372 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0012  hypothetical protein  20.07 
 
 
375 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4573  hypothetical protein  25 
 
 
370 aa  43.9  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.278248  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0360  hypothetical protein  20.69 
 
 
380 aa  43.1  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.102743  decreased coverage  0.00986478 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4837  DGQHR domain protein  23.42 
 
 
249 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.564526 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>