18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1849 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3403  hypothetical protein  99.72 
 
 
354 aa  741    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2571  hypothetical protein  97.18 
 
 
354 aa  700    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000749327  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1849  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  742    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00226909  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0472  hypothetical protein  27.17 
 
 
361 aa  145  9e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.772417 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2305  hypothetical protein  26.85 
 
 
369 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.468851  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0746  hypothetical protein  25.89 
 
 
355 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000170562  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0738  hypothetical protein  25.56 
 
 
375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677838  normal  0.0727241 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0170  DNA sulfur modification protein DndB  24.79 
 
 
372 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4573  hypothetical protein  26.24 
 
 
370 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.278248  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0360  hypothetical protein  24.28 
 
 
380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.102743  decreased coverage  0.00986478 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0834  hypothetical protein  24.8 
 
 
364 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2473  hypothetical protein  24.79 
 
 
358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1367  DNA sulfur modification protein DndB  23.56 
 
 
380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0012  hypothetical protein  25.07 
 
 
375 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4837  DGQHR domain protein  24.22 
 
 
249 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.564526 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3764  DGQHR domain protein  25.58 
 
 
409 aa  62.8  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2404  DGQHR domain protein  24.32 
 
 
422 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3948  hypothetical protein  27.27 
 
 
769 aa  59.7  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0773653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>