19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3764 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3764  DGQHR domain protein  100 
 
 		 409 aa  846    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2404  DGQHR domain protein  30.67 
 
 		 422 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4839  DGQHR domain protein  22.92 
 
 		 391 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.512859 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2460  DGQHR domain protein  23.62 
 
 		 400 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0189337 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1367  DNA sulfur modification protein DndB  23.4 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2305  hypothetical protein  23.17 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.468851  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2473  hypothetical protein  23.79 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0834  hypothetical protein  24.85 
 
 		 364 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0170  DNA sulfur modification protein DndB  22.41 
 
 		 372 aa  67  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0746  hypothetical protein  25.91 
 
 		 355 aa  65.1  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000170562  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0738  hypothetical protein  22.09 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677838  normal  0.0727241 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0472  hypothetical protein  24.42 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.772417 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3403  hypothetical protein  25.58 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1849  hypothetical protein  25.58 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00226909  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2571  hypothetical protein  25.58 
 
 		 354 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000749327  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0360  hypothetical protein  22.93 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.102743  decreased coverage  0.00986478 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4837  DGQHR domain protein  27.07 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.564526 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0012  hypothetical protein  28.25 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4573  hypothetical protein  25.36 
 
 		 370 aa  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.278248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>