19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0170 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0170  DNA sulfur modification protein DndB  100 
 
 
372 aa  755    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0738  hypothetical protein  55.5 
 
 
375 aa  403  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677838  normal  0.0727241 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1367  DNA sulfur modification protein DndB  52.34 
 
 
380 aa  391  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0012  hypothetical protein  56.98 
 
 
375 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2473  hypothetical protein  52.82 
 
 
358 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0472  hypothetical protein  47.24 
 
 
361 aa  348  1e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.772417 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2305  hypothetical protein  46.65 
 
 
369 aa  347  1e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.468851  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0360  hypothetical protein  48.71 
 
 
380 aa  346  4e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.102743  decreased coverage  0.00986478 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4573  hypothetical protein  49.86 
 
 
370 aa  325  1e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.278248  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0834  hypothetical protein  43.68 
 
 
364 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0746  hypothetical protein  41.6 
 
 
355 aa  278  1e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000170562  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4837  DGQHR domain protein  43.93 
 
 
249 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.564526 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2571  hypothetical protein  23.97 
 
 
354 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000749327  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3403  hypothetical protein  23.14 
 
 
354 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1849  hypothetical protein  23.14 
 
 
354 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00226909  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2404  DGQHR domain protein  20.42 
 
 
422 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3764  DGQHR domain protein  22.41 
 
 
409 aa  67.4  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2460  DGQHR domain protein  22.41 
 
 
400 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0189337 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4839  DGQHR domain protein  20.27 
 
 
391 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.512859 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>