12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2460 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2460  DGQHR domain protein  100 
 
 
400 aa  827    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0189337 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4839  DGQHR domain protein  66.92 
 
 
391 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.512859 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2404  DGQHR domain protein  24.06 
 
 
422 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3764  DGQHR domain protein  23.62 
 
 
409 aa  82.8  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0360  hypothetical protein  22.13 
 
 
380 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.102743  decreased coverage  0.00986478 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0170  DNA sulfur modification protein DndB  22.41 
 
 
372 aa  54.7  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4573  hypothetical protein  25.43 
 
 
370 aa  53.9  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.278248  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2473  hypothetical protein  22.91 
 
 
358 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0472  hypothetical protein  22.15 
 
 
361 aa  48.9  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.772417 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0738  hypothetical protein  21.23 
 
 
375 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677838  normal  0.0727241 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1367  DNA sulfur modification protein DndB  20.32 
 
 
380 aa  47.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0012  hypothetical protein  21.29 
 
 
375 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>