13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2646 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2646  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  712    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4376  hypothetical protein  37.01 
 
 		 372 aa  205  9e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4378  hypothetical protein  33.24 
 
 		 377 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2648  hypothetical protein  33.15 
 
 		 373 aa  150  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.335863 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2936  hypothetical protein  25.75 
 
 		 399 aa  97.8  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.087156  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3315  hypothetical protein  24.76 
 
 		 396 aa  59.7  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.607965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2956  hypothetical protein  27 
 
 		 405 aa  55.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0280124  normal  0.865149 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1367  hypothetical protein  25.28 
 
 		 401 aa  54.3  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0820  hypothetical protein  24.32 
 
 		 348 aa  52.8  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4008  DGQHR domain protein  26.09 
 
 		 382 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2087  hypothetical protein  24.77 
 
 		 617 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.500314  normal  0.260401 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5364  dgqhr domain, putative  22.78 
 
 		 415 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00112858  hitchhiker  0.00000000329618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2404  DGQHR domain protein  28.17 
 
 		 422 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>