11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4378 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4378  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  764    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2648  hypothetical protein  48.08 
 
 		 373 aa  329  6e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.335863 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4376  hypothetical protein  39.14 
 
 		 372 aa  239  6.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2646  hypothetical protein  33.24 
 
 		 347 aa  160  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2936  hypothetical protein  25.26 
 
 		 399 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.087156  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3315  hypothetical protein  26.49 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.607965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4008  DGQHR domain protein  25.65 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0820  hypothetical protein  25.67 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1367  hypothetical protein  24.42 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3948  hypothetical protein  24.38 
 
 		 769 aa  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0773653  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0472  hypothetical protein  22.91 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.772417 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>