18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3948 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009426  Saro_3948  hypothetical protein  100 
 
 		 769 aa  1592    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0773653  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5365  hypothetical protein  28.85 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.383398  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3403  hypothetical protein  27 
 
 		 354 aa  59.7  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1849  hypothetical protein  27 
 
 		 354 aa  59.7  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00226909  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2571  hypothetical protein  27 
 
 		 354 aa  60.1  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000749327  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3298  hypothetical protein  30.41 
 
 		 579 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2087  hypothetical protein  31.25 
 
 		 617 aa  58.2  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.500314  normal  0.260401 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2956  hypothetical protein  29.25 
 
 		 405 aa  55.1  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0280124  normal  0.865149 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0942  dgqhr domain-containing protein  25.27 
 
 		 579 aa  53.1  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4378  hypothetical protein  24.38 
 
 		 377 aa  52  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6301  DGQHR domain protein  24.92 
 
 		 341 aa  51.2  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1367  hypothetical protein  25.67 
 
 		 401 aa  50.4  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4008  DGQHR domain protein  23.65 
 
 		 382 aa  50.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3945  hypothetical protein  28.64 
 
 		 335 aa  49.3  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.250002  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0820  hypothetical protein  23.41 
 
 		 348 aa  48.9  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5364  dgqhr domain, putative  28.96 
 
 		 415 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00112858  hitchhiker  0.00000000329618 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3315  hypothetical protein  25.3 
 
 		 396 aa  48.1  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.607965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2648  hypothetical protein  25.47 
 
 		 373 aa  47.8  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.335863 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>