12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2956 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2956  hypothetical protein  100 
 
 
405 aa  839    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0280124  normal  0.865149 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3315  hypothetical protein  27.95 
 
 
396 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.607965  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1367  hypothetical protein  29.64 
 
 
401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4008  DGQHR domain protein  27.35 
 
 
382 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0820  hypothetical protein  26.32 
 
 
348 aa  101  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4720  hypothetical protein  33.96 
 
 
144 aa  67.8  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.485376  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5365  hypothetical protein  30.26 
 
 
345 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.383398  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5364  dgqhr domain, putative  30.37 
 
 
415 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00112858  hitchhiker  0.00000000329618 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2646  hypothetical protein  27 
 
 
347 aa  55.8  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3948  hypothetical protein  29.25 
 
 
769 aa  55.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0773653  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1840  hypothetical protein  39.44 
 
 
506 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4376  hypothetical protein  23.13 
 
 
372 aa  46.6  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>