14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0820 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0820  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  725    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4008  DGQHR domain protein  53.22 
 
 
382 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1367  hypothetical protein  46.07 
 
 
401 aa  315  5e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3315  hypothetical protein  46.61 
 
 
396 aa  306  5.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.607965  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2956  hypothetical protein  26.32 
 
 
405 aa  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0280124  normal  0.865149 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5364  dgqhr domain, putative  22.56 
 
 
415 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00112858  hitchhiker  0.00000000329618 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4378  hypothetical protein  25.67 
 
 
377 aa  64.3  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5365  hypothetical protein  29.14 
 
 
345 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.383398  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2648  hypothetical protein  24.26 
 
 
373 aa  54.3  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.335863 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1840  hypothetical protein  27.13 
 
 
506 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2646  hypothetical protein  24.32 
 
 
347 aa  52.8  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3948  hypothetical protein  23.41 
 
 
769 aa  48.9  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0773653  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6301  DGQHR domain protein  21.33 
 
 
341 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483477  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4376  hypothetical protein  25.7 
 
 
372 aa  43.5  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>