34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1349 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1349  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  325  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3166  hypothetical protein  51.22 
 
 
168 aa  176  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2290  hypothetical protein  57.97 
 
 
162 aa  154  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3315  hypothetical protein  47.24 
 
 
183 aa  121  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.058747  normal  0.494088 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4709  hypothetical protein  45.86 
 
 
172 aa  120  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144327  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3995  hypothetical protein  43.31 
 
 
171 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77817  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5816  conserved hypothetical conserved membrane protein  45.04 
 
 
160 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4155  hypothetical protein  44.44 
 
 
175 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.422763 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4523  hypothetical protein  43.65 
 
 
175 aa  110  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2237  hypothetical protein  45.52 
 
 
163 aa  110  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4920  hypothetical protein  47.37 
 
 
169 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  hitchhiker  0.00253688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4391  hypothetical protein  47.01 
 
 
168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4637  hypothetical protein  45.54 
 
 
176 aa  103  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.647115  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3559  hypothetical protein  39.86 
 
 
289 aa  102  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.804101  normal  0.917647 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1957  hypothetical protein  42.68 
 
 
183 aa  101  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522504  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3500  hypothetical protein  46.72 
 
 
141 aa  101  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.452479  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1484  hypothetical protein  38.46 
 
 
166 aa  97.4  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3872  hypothetical protein  40.82 
 
 
150 aa  91.7  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000157115  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7965  hypothetical protein  39.23 
 
 
179 aa  89  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8711  hypothetical protein  39.23 
 
 
179 aa  89  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0468  membrane protein-like  37.68 
 
 
265 aa  80.9  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475602  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3085  hypothetical protein  30.22 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.223752  hitchhiker  0.00814812 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0082  membrane protein-like protein  29.01 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3553  Protein of unknown function DUF2243, membrane  31.97 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0445517  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3145  hypothetical protein  32.33 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.447706  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3123  hypothetical protein  32.33 
 
 
168 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2829  hypothetical protein  31.58 
 
 
168 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.906076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3120  hypothetical protein  30.15 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2902  hypothetical protein  30.15 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0662345  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2872  hypothetical protein  30.83 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00613678  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3139  hypothetical protein  44.3 
 
 
134 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.478903  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21050  predicted membrane protein  26.8 
 
 
178 aa  58.9  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1099  Protein of unknown function DUF2243, membrane  30.3 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17490  hypothetical protein  29.32 
 
 
152 aa  52.4  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0109025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>