33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_17490 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_17490  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  295  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0109025  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0082  membrane protein-like protein  55.7 
 
 
156 aa  148  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2902  hypothetical protein  50.76 
 
 
168 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0662345  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3120  hypothetical protein  50.76 
 
 
168 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2829  hypothetical protein  50.76 
 
 
168 aa  143  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.906076  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2872  hypothetical protein  50 
 
 
168 aa  141  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00613678  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3123  hypothetical protein  50 
 
 
168 aa  141  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3145  hypothetical protein  48.48 
 
 
168 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.447706  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1099  Protein of unknown function DUF2243, membrane  56.2 
 
 
145 aa  133  9e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3553  Protein of unknown function DUF2243, membrane  48.97 
 
 
166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0445517  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3085  hypothetical protein  52.14 
 
 
146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.223752  hitchhiker  0.00814812 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21050  predicted membrane protein  44.97 
 
 
178 aa  120  7e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3500  hypothetical protein  36 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.452479  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3872  hypothetical protein  36.69 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000157115  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4523  hypothetical protein  36.5 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4155  hypothetical protein  36.5 
 
 
175 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.422763 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1484  hypothetical protein  34.21 
 
 
166 aa  62  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5816  conserved hypothetical conserved membrane protein  34.09 
 
 
160 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3995  hypothetical protein  35.29 
 
 
171 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77817  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3166  hypothetical protein  29.2 
 
 
168 aa  57.8  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2237  hypothetical protein  32.52 
 
 
163 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4391  hypothetical protein  30.23 
 
 
168 aa  57  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3559  hypothetical protein  30.65 
 
 
289 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.804101  normal  0.917647 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2290  hypothetical protein  31.19 
 
 
162 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1957  hypothetical protein  30.23 
 
 
183 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522504  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4920  hypothetical protein  34.88 
 
 
169 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  hitchhiker  0.00253688 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4637  hypothetical protein  34.26 
 
 
176 aa  53.9  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.647115  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3315  hypothetical protein  34.09 
 
 
183 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.058747  normal  0.494088 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1349  hypothetical protein  31.2 
 
 
164 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4709  hypothetical protein  26.95 
 
 
172 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144327  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0468  membrane protein-like  30.65 
 
 
265 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475602  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7965  hypothetical protein  29.25 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8711  hypothetical protein  29.25 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>