34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3559 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3559  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  556  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.804101  normal  0.917647 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0468  membrane protein-like  44.87 
 
 		 265 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475602  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3166  hypothetical protein  38.46 
 
 		 168 aa  96.7  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3995  hypothetical protein  41.67 
 
 		 171 aa  93.2  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2290  hypothetical protein  41.73 
 
 		 162 aa  89.4  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3315  hypothetical protein  41.53 
 
 		 183 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.058747  normal  0.494088 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1349  hypothetical protein  39.86 
 
 		 164 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5816  conserved hypothetical conserved membrane protein  42.24 
 
 		 160 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4709  hypothetical protein  39.26 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144327  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1957  hypothetical protein  34.81 
 
 		 183 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4523  hypothetical protein  40.18 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4391  hypothetical protein  34.72 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4155  hypothetical protein  40.18 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.422763 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4637  hypothetical protein  39.29 
 
 		 176 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.647115  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4920  hypothetical protein  36.18 
 
 		 169 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  hitchhiker  0.00253688 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1484  hypothetical protein  35.88 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3872  hypothetical protein  36.89 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000157115  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2237  hypothetical protein  37.5 
 
 		 163 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3500  hypothetical protein  37.93 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.452479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0082  membrane protein-like protein  31.01 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8711  hypothetical protein  32.46 
 
 		 179 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7965  hypothetical protein  32.46 
 
 		 179 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3085  hypothetical protein  34.43 
 
 		 146 aa  58.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.223752  hitchhiker  0.00814812 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17490  hypothetical protein  30.65 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0109025  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3145  hypothetical protein  27.27 
 
 		 168 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.447706  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3139  hypothetical protein  44.26 
 
 		 134 aa  52.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.478903  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3553  Protein of unknown function DUF2243, membrane  29.31 
 
 		 166 aa  52.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0445517  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2829  hypothetical protein  27.34 
 
 		 168 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.906076  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3123  hypothetical protein  27.34 
 
 		 168 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3120  hypothetical protein  27.2 
 
 		 168 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2902  hypothetical protein  27.2 
 
 		 168 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0662345  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2872  hypothetical protein  27.34 
 
 		 168 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00613678  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21050  predicted membrane protein  26.32 
 
 		 178 aa  44.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1099  Protein of unknown function DUF2243, membrane  30.53 
 
 		 145 aa  43.5  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>