22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3139 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3139  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  268  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.478903  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3315  hypothetical protein  60.42 
 
 		 183 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.058747  normal  0.494088 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3995  hypothetical protein  44.09 
 
 		 171 aa  98.6  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5816  conserved hypothetical conserved membrane protein  45.83 
 
 		 160 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4920  hypothetical protein  44.68 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  hitchhiker  0.00253688 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3166  hypothetical protein  39.25 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4523  hypothetical protein  45.74 
 
 		 175 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4155  hypothetical protein  44.68 
 
 		 175 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.422763 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4637  hypothetical protein  44.68 
 
 		 176 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.647115  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2290  hypothetical protein  38.54 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2237  hypothetical protein  41.49 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7965  hypothetical protein  53.12 
 
 		 179 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8711  hypothetical protein  53.12 
 
 		 179 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3559  hypothetical protein  38.83 
 
 		 289 aa  62  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.804101  normal  0.917647 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4709  hypothetical protein  41.82 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144327  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1957  hypothetical protein  38 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4391  hypothetical protein  35.35 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1349  hypothetical protein  32.98 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3500  hypothetical protein  36.84 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.452479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0468  membrane protein-like  40.82 
 
 		 265 aa  42.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475602  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1484  hypothetical protein  28.97 
 
 		 166 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2829  hypothetical protein  28.3 
 
 		 168 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.906076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>