34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0468 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0468  membrane protein-like  100 
 
 		 265 aa  513  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475602  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3559  hypothetical protein  45.63 
 
 		 289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.804101  normal  0.917647 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3166  hypothetical protein  36.49 
 
 		 168 aa  88.2  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4709  hypothetical protein  45.67 
 
 		 172 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144327  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3995  hypothetical protein  38.3 
 
 		 171 aa  88.2  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1957  hypothetical protein  37.31 
 
 		 183 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4155  hypothetical protein  38.97 
 
 		 175 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.422763 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4523  hypothetical protein  38.24 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3315  hypothetical protein  37.31 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.058747  normal  0.494088 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2290  hypothetical protein  40.6 
 
 		 162 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5816  conserved hypothetical conserved membrane protein  42.98 
 
 		 160 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4391  hypothetical protein  36.64 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1349  hypothetical protein  36 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3500  hypothetical protein  37.5 
 
 		 141 aa  71.6  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.452479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3872  hypothetical protein  40.44 
 
 		 150 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000157115  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4637  hypothetical protein  37.96 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.647115  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4920  hypothetical protein  35.77 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  hitchhiker  0.00253688 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2237  hypothetical protein  37.96 
 
 		 163 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.029766 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1484  hypothetical protein  35.96 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7965  hypothetical protein  32.85 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8711  hypothetical protein  32.85 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3553  Protein of unknown function DUF2243, membrane  31.33 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0445517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3085  hypothetical protein  32.14 
 
 		 146 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.223752  hitchhiker  0.00814812 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2902  hypothetical protein  27.52 
 
 		 168 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0662345  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3120  hypothetical protein  27.52 
 
 		 168 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21050  predicted membrane protein  35.14 
 
 		 178 aa  54.3  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2829  hypothetical protein  27.52 
 
 		 168 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.906076  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3123  hypothetical protein  30.07 
 
 		 168 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0082  membrane protein-like protein  28.37 
 
 		 156 aa  53.9  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3145  hypothetical protein  29.49 
 
 		 168 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.447706  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2872  hypothetical protein  26.85 
 
 		 168 aa  52.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00613678  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17490  hypothetical protein  31.15 
 
 		 152 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0109025  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3139  hypothetical protein  44.26 
 
 		 134 aa  45.8  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.478903  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1099  Protein of unknown function DUF2243, membrane  31.45 
 
 		 145 aa  43.5  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>