45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_51420 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_51420  PqsB  100 
 
 		 283 aa  564  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000095284 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4401  hypothetical protein  97.17 
 
 		 283 aa  531  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5524  hypothetical protein  40.34 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5764  hypothetical protein  40.34 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.737508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2034  hypothetical protein  38.32 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0745  hypothetical protein  38.32 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0654  hypothetical protein  38.32 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1934  hypothetical protein  41.76 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6246  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  28.04 
 
 		 345 aa  52.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2750  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  28.47 
 
 		 326 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2842  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  28.47 
 
 		 326 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.61653  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2934  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  28.47 
 
 		 326 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_89176  predicted protein  33.64 
 
 		 372 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349651  normal  0.271702 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1523  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  31.58 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00187738  normal  0.904573 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1183  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  36.96 
 
 		 325 aa  47  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6403  Beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase I  30.22 
 
 		 338 aa  46.6  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1136  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.4 
 
 		 324 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.896107  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0005  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  34.15 
 
 		 331 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0574  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  29.91 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.383366  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0223  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.42 
 
 		 348 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.583463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2923  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.12 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.437795  hitchhiker  0.000795877 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4090  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  31.06 
 
 		 326 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1043  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  31.85 
 
 		 333 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0109736 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0005  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  33.33 
 
 		 331 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0169  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.79 
 
 		 328 aa  43.9  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0323  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  30.43 
 
 		 322 aa  43.9  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2075  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  30.82 
 
 		 335 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317439  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0749  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.98 
 
 		 310 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000257819  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10260  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  28 
 
 		 331 aa  43.5  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00789963  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0005  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  32.48 
 
 		 335 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0744  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  37.36 
 
 		 328 aa  43.5  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.968089  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0713  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.61 
 
 		 331 aa  43.1  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.36705 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0016  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.94 
 
 		 327 aa  43.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000262352  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0005  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  33.33 
 
 		 331 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.506079  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1517  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  27.4 
 
 		 332 aa  43.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0306448  hitchhiker  0.00584561 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0005  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  35.77 
 
 		 331 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459918 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3995  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  30.3 
 
 		 326 aa  43.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.413867  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07545  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase  27.88 
 
 		 335 aa  42.7  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000084  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III protein 2  29.27 
 
 		 364 aa  42.7  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61467  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05699  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  31.87 
 
 		 365 aa  42.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0459  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  29.91 
 
 		 336 aa  42.4  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2015  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  28.03 
 
 		 326 aa  42.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0936  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  28.8 
 
 		 331 aa  42.4  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0689  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  36.26 
 
 		 362 aa  42.4  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.896722  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3112  Beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase I  29.03 
 
 		 325 aa  42  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0271705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>