More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3101 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3101  ribosomal protein L19  100 
 
 
144 aa  287  4e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0729095 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1708  50S ribosomal protein L19  60.91 
 
 
114 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00482278  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0198  ribosomal protein L19  57.76 
 
 
115 aa  135  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000492639  normal  0.504324 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  55.08 
 
 
118 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  60 
 
 
114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  56.48 
 
 
114 aa  128  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0714  50S ribosomal protein L19  55.86 
 
 
116 aa  127  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000264859  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  55.75 
 
 
116 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0789  50S ribosomal protein L19  53.85 
 
 
127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  9.23665e-16  unclonable  1.39809e-28 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  57.02 
 
 
113 aa  126  8.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 
114 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  55.56 
 
 
115 aa  125  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 
114 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 
114 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 
114 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 
114 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 
114 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1962  50S ribosomal protein L19  50 
 
 
115 aa  125  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 
114 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 
114 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  60.91 
 
 
128 aa  125  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 
114 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1144  50S ribosomal protein L19  55.56 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000366814  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2852  ribosomal protein L19  57.02 
 
 
114 aa  124  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151423  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 
114 aa  124  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2473  ribosomal protein L19  57.02 
 
 
114 aa  124  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0607  50S ribosomal protein L19  53.45 
 
 
119 aa  123  1e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000101225  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1360  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 
117 aa  122  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1213  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 
117 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000888328  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1290  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 
117 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000003977  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1257  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 
117 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000504967  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3100  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 
117 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026861  normal  0.106468 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2835  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 
117 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000148121  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2917  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 
117 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000128835  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3014  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 
117 aa  122  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000550721  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0892  50S ribosomal protein L19  54.39 
 
 
117 aa  122  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00545492  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  52.17 
 
 
128 aa  122  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1171  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 
117 aa  122  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251517  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  53.7 
 
 
114 aa  121  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1373  LSU ribosomal protein L19P  58.1 
 
 
113 aa  121  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000974692  normal  0.351017 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01708  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 
120 aa  120  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0189538  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  57.41 
 
 
114 aa  121  4e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  52.14 
 
 
116 aa  120  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2917  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 
117 aa  120  9e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000537691  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2751  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 
117 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000896071  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3002  50S ribosomal protein L19  53.15 
 
 
115 aa  119  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00296936  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3044  50S ribosomal protein L19  53.15 
 
 
115 aa  119  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00272781  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0040  ribosomal protein L19  58.95 
 
 
115 aa  118  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.266371  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0190  50S ribosomal protein L19  49.23 
 
 
133 aa  118  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1404  ribosomal protein L19  53.15 
 
 
115 aa  118  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243932  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0297  50S ribosomal protein L19  50 
 
 
121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  50.47 
 
 
116 aa  117  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  53.1 
 
 
115 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  55.26 
 
 
115 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2899  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 
132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  54.31 
 
 
115 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0802  50S ribosomal protein L19  50 
 
 
162 aa  117  4.9999999999999996e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  54.81 
 
 
115 aa  117  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0652  50S ribosomal protein L19  53.51 
 
 
117 aa  117  7e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.520317  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10020  LSU ribosomal protein L19P  51.82 
 
 
116 aa  117  7.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.155501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  50.47 
 
 
116 aa  116  9e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  50.47 
 
 
116 aa  116  9e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1680  50S ribosomal protein L19  50.52 
 
 
117 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.167471  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  55.14 
 
 
113 aa  116  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  55.24 
 
 
113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0217  50S ribosomal protein L19  50.91 
 
 
131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  55.86 
 
 
131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0983  50S ribosomal protein L19  51.75 
 
 
120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1580  50S ribosomal protein L19  53.15 
 
 
120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3132  ribosomal protein L19  51.75 
 
 
116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10370  LSU ribosomal protein L19P  53.15 
 
 
114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000106379  unclonable  0.000000000798252 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0956  50S ribosomal protein L19  49.22 
 
 
132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.670119 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0430  ribosomal protein L19  46.3 
 
 
121 aa  114  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575588  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002539  LSU ribosomal protein L19p  52.63 
 
 
117 aa  115  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000131397  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2090  ribosomal protein L19  55.14 
 
 
113 aa  115  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2107  50S ribosomal protein L19  58.95 
 
 
148 aa  114  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00250382  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4734  50S ribosomal protein L19  54.21 
 
 
134 aa  114  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03477  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 
117 aa  115  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5201  50S ribosomal protein L19  54.21 
 
 
134 aa  114  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2185  50S ribosomal protein L19  51.75 
 
 
114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0675384  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  51.85 
 
 
114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0302  ribosomal protein L19  54.29 
 
 
116 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07350  ribosomal protein L19  56.14 
 
 
124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105105  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 
117 aa  114  6e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1127  50S ribosomal protein L19  53.51 
 
 
115 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.658651  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5922  ribosomal protein L19  50.88 
 
 
119 aa  114  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0433266  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07000  LSU ribosomal protein L19P  51.35 
 
 
114 aa  113  6.9999999999999995e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000223468  normal  0.416824 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3087  50S ribosomal protein L19  53.51 
 
 
115 aa  113  7.999999999999999e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.228152  normal  0.0603569 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02495  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 
115 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0233029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1068  ribosomal protein L19  52.63 
 
 
115 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000854887  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5273  50S ribosomal protein L19  53.77 
 
 
130 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2765  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 
115 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315914  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3845  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 
115 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0054034  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02459  hypothetical protein  52.63 
 
 
115 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0136468  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0855  50S ribosomal protein L19  53.51 
 
 
118 aa  113  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000174926  hitchhiker  0.0000579637 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  57.28 
 
 
118 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2758  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 
115 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0531203  normal  0.0143177 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1077  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 
115 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00292053  hitchhiker  0.00675829 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2890  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 
115 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00198618  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2995  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 
115 aa  113  8.999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0184061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>