28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1874 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1874  cobalt transporter, subunit CbtA  100 
 
 
237 aa  457  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.245777  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1309  hypothetical protein  89.92 
 
 
238 aa  355  2.9999999999999997e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.236923  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1272  hypothetical protein  89.5 
 
 
238 aa  352  2e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1440  cobalt transporter, subunit CbtA  47.2 
 
 
258 aa  159  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.473555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1443  cobalt transporter, subunit CbtA  46.96 
 
 
255 aa  146  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.376445 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1718  cobalt transporter, subunit CbtA  46.15 
 
 
255 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19102  normal  0.0137404 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3112  cobalt transporter, subunit CbtA  44.35 
 
 
250 aa  143  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0398133  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3152  hypothetical protein  43 
 
 
240 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00956789  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2434  cobalt transporter, subunit CbtA  43.23 
 
 
241 aa  135  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.189525 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3101  cobalt transporter subunit CbtA, putative  39.71 
 
 
233 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3775  cobalt transporter, subunit CbtA  43.89 
 
 
242 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.461264  normal  0.391945 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2532  cobalt transporter, subunit CbtA  43.06 
 
 
228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00862817 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2354  cobalt transporter, subunit CbtA  40.78 
 
 
228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4714  cobalt transporter, subunit CbtA  38.4 
 
 
241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6984  cobalt transporter, subunit CbtA  35.98 
 
 
241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2146  cobalt transporter, subunit CbtA  43.98 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738825  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2777  cobalt transporter, subunit CbtA  42.11 
 
 
236 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0561965  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3018  hypothetical protein  40.78 
 
 
240 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.960935  normal  0.157987 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2525  cobalt transporter, subunit CbtA  32.77 
 
 
232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2215  hypothetical protein  40.87 
 
 
233 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25940  hypothetical protein  43.92 
 
 
364 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00053463  normal  0.0606013 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2222  cobalt transporter subunit CbtA, putative  34.3 
 
 
257 aa  105  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.338771  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2301  hypothetical protein  40.14 
 
 
181 aa  84.3  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.395641  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0161  possible cobalt transporter, subunit CbtA  33.33 
 
 
229 aa  81.3  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.528614  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2768  hypothetical protein  29.54 
 
 
275 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.319102  normal  0.0713993 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2154  hypothetical protein  29.39 
 
 
275 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0542665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1015  hypothetical protein  32.24 
 
 
263 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.819928  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0164  hypothetical protein  26.21 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>