27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1015 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1015  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  509  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.819928  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2154  hypothetical protein  70.5 
 
 		 275 aa  300  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0542665 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2768  hypothetical protein  70.41 
 
 		 275 aa  278  7e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.319102  normal  0.0713993 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0481  hypothetical protein  57.09 
 
 		 279 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.844634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0446  hypothetical protein  57.09 
 
 		 279 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0964398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4714  cobalt transporter, subunit CbtA  34.52 
 
 		 241 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3101  cobalt transporter subunit CbtA, putative  33.03 
 
 		 233 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6984  cobalt transporter, subunit CbtA  31.3 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2532  cobalt transporter, subunit CbtA  32.88 
 
 		 228 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00862817 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3775  cobalt transporter, subunit CbtA  36.63 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.461264  normal  0.391945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2354  cobalt transporter, subunit CbtA  36.65 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3112  cobalt transporter, subunit CbtA  31.22 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0398133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1440  cobalt transporter, subunit CbtA  32.3 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.473555 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3152  hypothetical protein  32.1 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00956789  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2777  cobalt transporter, subunit CbtA  32.6 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0561965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2215  hypothetical protein  36.44 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25940  hypothetical protein  39.68 
 
 		 364 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00053463  normal  0.0606013 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1443  cobalt transporter, subunit CbtA  31.73 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.376445 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3018  hypothetical protein  32.24 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.960935  normal  0.157987 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1718  cobalt transporter, subunit CbtA  30.77 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19102  normal  0.0137404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2146  cobalt transporter, subunit CbtA  30.86 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738825  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2222  cobalt transporter subunit CbtA, putative  31.25 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.338771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2525  cobalt transporter, subunit CbtA  29.8 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2434  cobalt transporter, subunit CbtA  32.1 
 
 		 241 aa  62  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.189525 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2301  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  53.1  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.395641  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1309  hypothetical protein  28.77 
 
 		 238 aa  46.2  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.236923  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1272  hypothetical protein  28.77 
 
 		 238 aa  45.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>