27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2301 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2301  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  347  6e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.395641  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3152  hypothetical protein  52.84 
 
 
240 aa  175  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00956789  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2532  cobalt transporter, subunit CbtA  51.72 
 
 
228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00862817 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2354  cobalt transporter, subunit CbtA  51.15 
 
 
228 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3101  cobalt transporter subunit CbtA, putative  49.39 
 
 
233 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2777  cobalt transporter, subunit CbtA  51.69 
 
 
236 aa  164  8e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0561965  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3018  hypothetical protein  52.27 
 
 
240 aa  154  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.960935  normal  0.157987 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2215  hypothetical protein  53.66 
 
 
233 aa  144  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25940  hypothetical protein  53.74 
 
 
364 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00053463  normal  0.0606013 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6984  cobalt transporter, subunit CbtA  43.58 
 
 
241 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4714  cobalt transporter, subunit CbtA  44.24 
 
 
241 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3775  cobalt transporter, subunit CbtA  40.22 
 
 
242 aa  96.3  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.461264  normal  0.391945 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3112  cobalt transporter, subunit CbtA  40.74 
 
 
250 aa  94.7  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0398133  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1309  hypothetical protein  41.53 
 
 
238 aa  89.4  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.236923  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1272  hypothetical protein  41.53 
 
 
238 aa  88.2  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1874  cobalt transporter, subunit CbtA  41.53 
 
 
237 aa  87.8  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.245777  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2525  cobalt transporter, subunit CbtA  37.75 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1440  cobalt transporter, subunit CbtA  38.27 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.473555 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2434  cobalt transporter, subunit CbtA  39.1 
 
 
241 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.189525 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1443  cobalt transporter, subunit CbtA  42.19 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.376445 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2222  cobalt transporter subunit CbtA, putative  37.41 
 
 
257 aa  78.6  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.338771  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1718  cobalt transporter, subunit CbtA  41.41 
 
 
255 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19102  normal  0.0137404 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0161  possible cobalt transporter, subunit CbtA  40.38 
 
 
229 aa  74.7  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.528614  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2146  cobalt transporter, subunit CbtA  37.18 
 
 
243 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738825  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2154  hypothetical protein  32.97 
 
 
275 aa  53.9  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0542665 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2768  hypothetical protein  32.42 
 
 
275 aa  51.2  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.319102  normal  0.0713993 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1015  hypothetical protein  33.71 
 
 
263 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.819928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>