14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_93346 on replicon NC_009364
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009364  OSTLU_93346  predicted protein  100 
 
 
700 aa  1411    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.274788  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30347  predicted protein  26.56 
 
 
458 aa  81.3  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.192095 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  28.41 
 
 
2449 aa  68.2  0.0000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04350  protein transporter, putative  21.45 
 
 
898 aa  66.2  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_3137  predicted protein  23.12 
 
 
392 aa  65.1  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03594  vacuolar protein sorting-associated protein Vps5, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12830)  20.75 
 
 
561 aa  58.9  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.108154  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24489  predicted protein  29.73 
 
 
357 aa  55.8  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03584  Sorting nexin-4 (Autophagy-related protein 24) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B797]  27.27 
 
 
487 aa  55.1  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06300  lipid binding protein, putative  22.85 
 
 
493 aa  53.9  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.153716  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54632  predicted protein  24.54 
 
 
591 aa  53.9  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.397245 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30264  putative golgi membrane protein-sorting protein  37.35 
 
 
158 aa  53.1  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.398749  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27578  predicted protein  20.61 
 
 
505 aa  53.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.57601  normal  0.151799 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03560  hypothetical protein  23.3 
 
 
638 aa  49.3  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45401  predicted protein  24.28 
 
 
830 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>