20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC06300 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC06300  lipid binding protein, putative  100 
 
 		 493 aa  1018    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.153716  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03584  Sorting nexin-4 (Autophagy-related protein 24) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B797]  36.84 
 
 		 487 aa  306  4.0000000000000004e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54632  predicted protein  21.73 
 
 		 591 aa  103  7e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.397245 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03560  hypothetical protein  24.28 
 
 		 638 aa  87  6e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10594  sorting nexin Snx3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06880)  35.77 
 
 		 142 aa  84  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04350  protein transporter, putative  33.08 
 
 		 898 aa  78.2  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02650  hypothetical protein  36.07 
 
 		 144 aa  77  0.0000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.369261  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30264  putative golgi membrane protein-sorting protein  31.97 
 
 		 158 aa  75.5  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.398749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_3137  predicted protein  23.17 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30347  predicted protein  32.8 
 
 		 458 aa  67.8  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.192095 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10918  sorting nexin Mvp1 (AFU_orthologue; AFUA_2G17180)  33.88 
 
 		 738 aa  64.7  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.547553 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_93346  predicted protein  21.47 
 
 		 700 aa  58.2  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.274788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80446  protein involved in Golgi retention and vacuolar sorting  29.37 
 
 		 684 aa  57.4  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.914331  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03550  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  38.27 
 
 		 612 aa  55.1  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.199341  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03594  vacuolar protein sorting-associated protein Vps5, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12830)  28.3 
 
 		 561 aa  55.1  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.108154  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06351  Sorting nexin-41 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AZC9]  24.92 
 
 		 615 aa  53.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45401  predicted protein  28.69 
 
 		 830 aa  53.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87650  predicted protein  22.34 
 
 		 619 aa  50.4  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.258342 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24489  predicted protein  35.37 
 
 		 357 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27578  predicted protein  28.07 
 
 		 505 aa  49.3  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.57601  normal  0.151799 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>